Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sin3aQ60520 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms