Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atp13a3Q5XF89 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp13a3Q5XF89 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms