Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms