Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uimc1Q5U5Q9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms