Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Tsr1Q5SWD9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tsr1Q5SWD9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms