Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc42Q5SV66 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc42Q5SV66 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms