Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms