Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arhgap44Q5SSM3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arhgap44Q5SSM3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms