Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Utp18Q5SSI6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Utp18Q5SSI6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms