Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc85aQ5SP85 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms