Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc88aQ5SNZ0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms