Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trim41Q5NCC3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms