Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnni3kQ5GIG6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnni3kQ5GIG6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms