Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SynaQ5G5D5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SynaQ5G5D5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms