Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam208bQ5DTT3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms