Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Spag9Q58A65 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Spag9Q58A65 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms