Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Urb1Q571H0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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