Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Eme2Q56A04 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms