Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa20Q45VN2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defa20Q45VN2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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