Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx25Q3ZT31 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx25Q3ZT31 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Snx25Q3ZT31 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx25Q3ZT31 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx25Q3ZT31 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx25Q3ZT31 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx25Q3ZT31 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx25Q3ZT31 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx25Q3ZT31 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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