Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pydc3Q3V3Q4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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