Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc185Q3V118 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms