Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
4930596D02RikQ3V0H9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms