Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrfip1Q3UZ39 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrfip1Q3UZ39 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms