Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Skap1Q3UUV5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms