Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arhgef40Q3UPH7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Arhgef40Q3UPH7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms