Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q3UPC7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q3UPC7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms