Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skap2Q3UND0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Skap2Q3UND0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms