Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cog7Q3UM29 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cog7Q3UM29 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms