Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp19Q3UJD6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp19Q3UJD6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms