Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm648Q3UJ22 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm648Q3UJ22 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm648Q3UJ22 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Gm648Q3UJ22 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm648Q3UJ22 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Gm648Q3UJ22 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm648Q3UJ22 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms