Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc34Q3UI66 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms