Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms