Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Q3U6N9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Q3U6N9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms