Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q3U595 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q3U595 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q3U595 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q3U595 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Q3U595 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms