Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hvcn1Q3U2S8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms