Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc9Q3U0M1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms