Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3TTJ4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3TTJ4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms