Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm21440Q3TTD8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm21440Q3TTD8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms