Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms