Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gdpgp1Q3TLS3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms