Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc10Q3TLI0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trappc10Q3TLI0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms