Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarca4Q3TKT4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms