Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdlim7Q3TJD7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms