Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc13Q3TIR1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc13Q3TIR1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms