Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cpne9Q1RLL3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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