Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam171bQ14CH0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms