Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc162pQ0VG85 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc162pQ0VG85 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms