Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tigd2Q0VBL1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tigd2Q0VBL1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms