Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms